Recep Bayyiğit, lisans eğitimini 2013-2018 yılları arasında İstanbul Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde tamamladı. 2018 yılında İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Bölümü / Din Sosyolojisi Anabilim Dalında  yüksek lisans eğitimine başladı. 2019 yılında Ankara Sosyal Bilimler Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde Araştırma Görevlisi olarak göreve başladıktan sonra ASBÜ İslami Araştırmalar Enstitüsü'nde aynı programa yatay geçiş yaptı. "İslamofobinin Tarihsel Boyutları" başlıklı teziyle yüksek lisans eğitiminden 2021 yılında mezun oldu. İslamofobi, İslam ve Siyaset, Dinî Kimlikler, Oryantalizm konularında çalışmalarını sürdüren Bayyiğit, ASBÜ İslami Araştırmalar Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Bölümü / Din Sosyolojisi Anabilim Dalında doktora eğitimine devam etmektedir.